New methods in molecular biology

1. KÉMIA és GENETIKA (ismétlés)

Mendeli genetika, genetikai információ    

2. MAKROMOLEKULÁK SZERKEZETE, GENOM (ismétlés)

Gyenge kémiai kölcsönhatások, nagy energiájú kötések  

3. A GENOM MŰKÖDTETÉSE

DNS, RNS szerkezet; kromoszóma, kromatin és nukleoszóma; DNS replikáció, mutáció, javítás; homológ rekombináció; helyspecifikus rekombináció és transzpozíció.

4. A GENOM MEGNYILVÁNULÁSA 

transzkripció, splicing; transzláció, genetikai kód, genomi bevésődés, géncsendesítés

5. SZABÁLYOZÁS

prokarióta és eukarióta génszabályozás; génszabályozás az egyedfejlődés során;

genomika és összehasonlító genomika; genomika, transzkriptomika, proteomika, metabolomika → rendszer-biológia (systems biology)

6. PROKARIÓTA HETEROLÓG EXPRESSZIÓS RENDSZEREK

E. coli, Bacillus, Streptomyces, Pseudomonas expressziós vektorok, lehetőségek, előnyök, hátrányok.

7. EUKARIÓTA HETEROLÓG EXPRESSZIÓS RENDSZEREK

Élesztő, fonalas gomba, növény, állat expressziós rendszerek, lehetőségek, előnyök, hátrányok.

8. HALLGATÓK BEMUTATÓI

A molekuláris genetikai módszerek gyakorlati alkalmazása: növény- és állat-nemesítés, mikroorganizmusok nemesítése, gyógyszergyártás, molekuláris orvoslás, stb. (Archives of…; Current Opinion of …; Trends in …; Nature Methods; Biotechniques;  stb. és aktuális folyóirat cikkek feldolgozása alapján.)

(GYAKORLAT)

Önálló kutatási feladat:

1. genom-szekvencia adatok alapján egy gén izolálása Bacillus licheniformis-ból, gén kiütés és sokszorozás hatásának vizsgálata,  a gén szabályozásának vizsgálata riporter génnel aerob és anaerob körülmények között.

1. szabályozható promóterek keresése gombákban inzerciós mutagenezissel, a mutáció azonosítása, a DNS szekvencia meghatározása, transzkripciós startpont meghatározása primer extenzióval.
2. DNS-fehérje, fehérje-fehérje kölcsönhatások vizsgálata élesztő kéthibrid rendszerben

(primer tervezés, biológiai adatbázisok használata, in silico módszerek)