Bioinformatika

A tematika négy nagyobb területet ölel fel:

1.)    A szekvencia homológián alapuló szerkezeti és funkcionális analízisek lehetőségeit és az ehhez a területhez köthető proteomikai adatbázisok ismertetését.

2.)    A rendezetlen fehérjék viszonlyag új tudományterületén alkalmazható predikciós lehetőségeket, adatbázisokat.

3.)    A fehérje interakciós és metabolikus hálózatok kezelésének matematikai alapjait.

4.)    Az újgenerációs szekvenálási eljárásokat, az általuk nyert nagymennnyiségű és változatos genomikai adatok feldolgozási és elemzési lehetőségeit.

·      A biomolekulák szerkezeti adatai és az adatgyüjtés módszerei

·      Az adatok reprezentációja és adatbázisai (rendezett és rendezetlen fehérjékre)

·      Az összehasonlítás, osztályozás és az előrejelzés alapfeladatai (rendezett és rendezetlen fehérjékre)

·      Biológiai szekvenciák összehasonlítása, páronkénti és többszörös összerendezése, adatbáziskeresés, fehérje-funkció előrejelzése.

·      Fehérjeszerkezetek összehasonlítása, összerendezése, adatbáziskeresés, szerkezet előrejelzése.

·      Hálózati reprezentációk, genom-adatok, metabolikus hálózatok

·      Újgenerációs szekvenálási (NGS) technikák és alkalmazások áttekintése

·      NGS adatok processzálása, különböző aspektusú feldolgozása (esettanulmányokon keresztül)

·      Rutinszerűen használatos bioinformatikai programok és programcsomagok, tudásbázisok (Elixír Magyarország)