Tömegspektrometria alapú proteomika (MSc)

Mass Spectrometry based proteomics (MSc)

A tantárgyleírás hatályossága

Hatályosság kezdete:

2026. March 21.

Hatályosság vége:

—

Tantárgy neve (magyarul, angolul)

Tömegspektrometria alapú proteomika (MSc)

Mass Spectrometry based proteomics (MSc)

Tantárgykód

BMEVESAM010

Tantárgyjelleg

—

Képzési szint

—

Kurzustípusok és óraszámok (heti/féléves)

Kurzustípus	elmélet	gyakorlat	laboratóriumi gyakorlat
óraszám (heti)	2	0	0
jelleg (kapcsolt/önálló)	—	—	—

Tanulmányi teljesítmény/értékelés típusa

vizsga

Tantárgy kreditértéke

Tantárgyfelelős

Dr. Tóth Blanka

beosztás: egyetemi docens

elérhetőség: toth.blanka@vbk.bme.hu

Tantárgyat gondozó oktatási szervezeti egység

Szervetlen és Analitikai Kémia Tanszék

https://www.ch.bme.hu/

Kar

Vegyészmérnöki és Biomérnöki Kar

Tantárgy weboldala

—

Tantárgy elsődleges mintatantervi jellege

—

Közvetlen előkövetelmények – Erős előkövetelmény

BMEVESAM009 (Tömegspektrometria (MSc)), BMEVESAM303 (Szerves szerkezetfelderítés II)

Közvetlen előkövetelmények – Gyenge előkövetelmény

nincs

Közvetlen előkövetelmények – Párhuzamos előkövetelmény

nincs

Közvetlen előkövetelmények – Mérföldkő előkövetelmény

nincs

Közvetlen előkövetelmények – Kizáró feltétel

nincs

Célkitűzés

Tantárgyprogram

1) Bevezetés, definíciók (proteomika definiciója, tömegspektrometria (MS) helye a proteomikában, MS alapú általános munkafolyamat, egyéb módszerek áttekintése)

2) Proteomikában használatos MS technikák, munkafolyamatok (MALDI, ESI, top down, middle-down, bottom up, DDA, DIA tandem tömegspektrometria, gél alapú és gélmentes technikák)

3) Mintaelőkészítés (extrakció, emésztés, enzimreaktorok, minta tisztítás)

4) Peptidek, fehérjék elválasztása (LC-MS, CE-MS, kolonnatöltés, speciális hosszú gradiens módszerek)

5) Komplex mintából történő (peptid és) fehérjeazonosítás folyamata, adatértékelés, publikálási követelmények, proteomikai szoftverek (Mascot, Byonic, SearchGUI)

6) Mennyiségi meghatározás (jelöléses vs. jelölésmentes ill. abszolút kvantitatív proteomika, statisztikai értékelés)

7) Célzott proteomika (MRM Assay, Skyline program alkalmazása)

8-9) Poszt-transzlációs módosítások vizsgálata: glikoziláció és foszforiláció

10) Fehérjehálózatok vizsgálata, bioinformatika

11-12) Speciális technikák: képalkotó módszerek és ionmobilitás alkalmazása a proteomikában, szenzorok, chip-technika

13) Példák, alkalmazások: orvosi diagnosztika, biokémia, MAB-ok vizsgálatának területéről

A tárgyat azoknak ajánljuk, akik a tömegspektrometria alapú proteomikával szeretnének részletesen megismerkedni.

Tanulmányi eredmények

Ez a tantárgy a KKK rendeletben meghatározott, következő kompetenciák fejlesztését szolgálja:

Tudás

Ismeri a vegyész-, és biomérnöki szakma gyakorláshoz kapcsolódó proteomikai alapismereteket. Ismeri a proteomikában használatos tömegspektrometriás technikákat és azok kiválasztási szempontjait. Ismeri a proteomikai mintaelőkészítés lépéseit, menetét és a peptidek elválasztására alkalmas módszereket. Ismeri a komplex mintából történő (peptid és) fehérjeazonosítás folyamatát, ill. az ehhez kapcsolódó adatértékelést. Ismeri a célzott és kvantitatív proteomikai technikákat és PTM-ek (glikoziláció, foszforiláció) meghatározásának folyamatát. Ismeri a fehérjehálózatok vizsgálatának alapjait.

Képességek

Képes kiválasztani egy adott proteomikai munkafolyamat megoldására alkalmas tömegspektrometriás technikákat. Képes eldönteni, hogy egy adott minta vizsgálatához milyen mintaelőkészítési technika (pl. enzim) alkalmazása szükséges. Képes megtervezni egy MS alapú kvalitatív és kvantitatív proteomikai vizsgálatot. Képes weben elérhető programok segítségével a tömegspektrometriás adatok proteomikai értékelésére

Attitűd

Képes weben elérhető programok segítségével a tömegspektrometriás adatok proteomikai értékelésére

Autonómia és felelősség

Analitikai kémiai problémák megoldása során önállóan és kezdeményezően lép fel.

Oktatási módszertan

Előadások.

Tanulástámogató anyagok

Online források

1. Drahos László, Schlosser; Gitta, Vékey Károly, Ezerarcú fehérjék; c. könyv 12. és 26. fejezetei., (szerkesztő: Buday László, Nyitray László,; Perczel András), Semmelweis Kiadó és Multimédia Stúdió, Budapest, 2018. (ISBN:; 9789633314586)

A tantárgy teljesítéséhez ajánlott előzetes ismeretek

Tudás típusú kompetenciák

(azon előzetes ismeretek összessége, amelyek megléte nem kötelező, de a tantárgy eredményes teljesítését nagyban elősegíti)

nincs

Képesség típusú kompetenciák

(azon előzetes képességek és készségek összessége, amelyek megléte nem kötelező, de a tantárgy eredményes teljesítését nagyban elősegíti)

nincs

Ajánlott (nem kötelező) előzetesen megszerzendő kompetenciák

(azon ajánlott (nem kötelező) előzetesen megszerzendő kompetenciák összessége, amelyek jelentősen hozzájárulnak a tantárgy eredményes teljesítéséhez)

Tömegspektrometria kurzus és analitikai, szerves kémiai ismeretek.

Általános szabályok

Követelmények: A tananyagot a félév végén kérjük számon, szóbeli vizsga formájában. Teljesítményértékelés neve (típus) jele értékelt tanulási eredmények Szóbeli vizsga V T1-6, K1-4, A1, O1 jele részarány V 100% Összesen 100% Pótlási lehetőségek: TVSz szerint Konzultációk: Konzultációs időpontok: E-mailben egyeztetve. E-mail: drahos.laszlo@ttk.hu és turiak.lilla@ttk.hu

Teljesítményértékelési módszerek

Szorgalmi időszakban végzett teljesítményértékelések részletes leírása

Nincs megadva részletes értékelés.

Szorgalmi időszakban végzett teljesítményértékelések részaránya

Nincs megadva részarány.

Vizsgaidőszakban végzett teljesítményértékelések részletes leírása

Nincs megadva részletes értékelés.

Vizsgarészek részaránya

Nincs megadva részarány.

Érdemjegy megállapítása

Nincs megadva érdemjegy határ.

Jelenléti és részvételi követelmények

Nincs megadva jelenléti követelmény.

Javítás, ismétlés és pótlás különös szabályai

Nincs megadva.

Rövid leírás

Nincs megadva.

Részletes leírás

Név: Beosztás: Tanszék, Int.: Dr. Drahos László és Dr. Turiák Lilla Tud. főmunkatárs Természettudományi Kutatóközpont

Ajánlott tantárgyak

Tevékenység óra/félév részvétel a kontakt tanórákon 13×2=26 felkészülés a vizsgára 26 összesen 52

A tantárgy elvégzéséhez szükséges tanulmányi munka

Nincs megadva munkaidő bontás.

Tantárgykövetelmények hatályossága

Tantárgykövetelmények hatályosságának kezdete:

—

Tantárgykövetelmények hatályosságának vége:

—

Tantervi elhelyezés

Kar	Képzés	Tanterv	Mintatantervi jelleg	Elsődleges
Vegyészmérnöki és Biomérnöki Kar	vegyészmérnöki	Vegyészmérnöki mesterképzési szak tanterve	—	nem
Vegyészmérnöki és Biomérnöki Kar	vegyészmérnöki	Vegyészmérnöki mesterképzési szak tanterve	—	nem
Vegyészmérnöki és Biomérnöki Kar	biomérnöki	Biomérnöki mesterképzési szak tanterve	—	nem
Vegyészmérnöki és Biomérnöki Kar	környezetmérnöki	Környezetmérnöki mesterképzési szak tanterve	—	nem
Vegyészmérnöki és Biomérnöki Kar	műanyag- és száltechnológiai mérnöki	Műanyag- és száltechnológiai mérnöki mesterképzési szak tanterve	—	nem
Default Faculty	biotechnológia	Biotechnológia mesterképzési szak tanterve	—	nem
Default Faculty	biotechnológia	Biotechnológia mesterképzési szak tanterve	—	nem
Default Faculty	biotechnológia	Biotechnológia mesterképzési szak tanterve	—	nem