Bioinformatika 2 - proteomika

Ismeri a szekvenciák (nukleotid és fehérjeszekvenciák) fogalmát, az ezek közti összefüggéseket, a páronkénti és többszörös összerendelés és a filogenetikai analízis módszereit; a fehérjék szerkezeti szerveződésének szintjeit, a domén analízis módszereit és a szerkezet – funkció előrejelzését szekvencia alapján. - Ismeri a szekvenciák (nukleotid és fehérjeszekvenciák) fogalmát, az ezek közti összefüggéseket, a páronkénti és többszörös összerendelés és a filogenetikai analízis módszereit; a fehérjék szerkezeti szerveződésének szintjeit, a domén analízis módszereit és a szerkezet – funkció előrejelzését szekvencia alapján. - Ismeri a genetikai és szerkezeti adatok összefüggéseit a molekuláris funkcióval és a metabolizmusban betöltött szereppel, valamint a proteomikai kérdésekkel összefüggő adatbázisokat (nukleotid és fehérje szekvencia, szerkezeti adatbázisok, funkcionális adatbázisok). Ismeri a fehérjék térszerkezet meghatározására alkalmas módszerek (proteinkrisztallográfia, NMR) alapelveit. Ismeri a proteomikai analízisek során használt elválasztási (pl. 2D elektroforézis) és elemzési (pl. MALDI-TOF tömegspektrometria) műveletek alapelveit Ismeri a fehérjék tulajdonságait és rekombináns előállításának módszereit. Ismeri a proteomikai kérdésekkel összefüggő adatbázisok (nukleotid és fehérje szekvencia, szerkezeti adatbázisok, funkcionális adatbázisok) és alkalmazhatóságuk feltételeit. Ismer több alapvető bioinformatikai programot és programrendszert proteomikai alkalmazásokhoz (önálló és Web alapú alkalmazások) és alkalmazhatóságuk feltételeit. Ismeri a fehérjék 3D szerkezetének modellezésére alkalmas módszereket és a homológia modellezés alapmódszereit (templát alalpú és ab initio modellezési módszerek). Ismeri a fehérjék kis molekulákkal történő kölcsönhatásainak vizsgálatára alkalmas bioinformatikai módszereket. Ismeri a fehérjék biológiai makromolekulákkal történő kölcsönhatásainak vizsgálatára alkalmas bioinformatikai módszereket. Ismeri a fehérjeszerkezetek dinamikájának tanulmányozására alkalmas bioinformatikai módszereket. A bioinformatikai módszereket felhasználó egy vagy több iparág fő műveleteit és technológiáit részleteiben ismeri és átlátja. A bioinformatikai folyamatokat megalapozó alapvető analitikai és szerkezetvizsgálati módszereket ismeri.

Alkotóan képes alkalmazni bioinformatikai módszerekhez kapcsolódó matematikai és természettudományos elméleti és gyakorlati ismereteket feladatai megoldása során. Képes bioinformatikát alkalmazó folyamatokkal kapcsolatban értékelésre és dokumentálásra, szükség esetén a vizsgálati módszerek továbbfejlesztésére, és új módszerek bevezetésére. Képes bioinformatikai módszerek alkalmazásával kapcsolatos eredeti ötletekkel és eredményekkel gazdagítani a vegyészmérnöki és kémiai szakterület tudásbázisát. Képes bioinformatikai módszerekkel kapcsolatos ismeretei integrált alkalmazására a kémiai technológiai folyamatok, berendezések és technológiai rendszerek fejlesztésében, irányításában, tervezésében és a kapcsolódó kutatásban. Képes bioinformatikai módszereket felhasználó technológiai rendszerek és folyamatok tervezésében, szervezésében és működtetésében használatos eljárások, modellek, információs technológiák alkalmazására és azok továbbfejlesztésére. Felkészült bioinformatikai módszereket felhasználó vegyipari és más szakterületek kémiai, technológiai tevékenységének irányítására, csapatmunka összefogására. Bioinformatikai módszerek alkalmazásával kapcsolatban képes a kreatív problémakezelésre és összetett feladatok rugalmas megoldására, továbbá az élethosszig tartó tanulásra, a nyitottság és az értékalapúság megtartásával.

Bioinformatikai módszerek alkalmazásával kapcsolatban törekszik szakmailag magas szinten önállóan vagy munkacsoportban megtervezni és végrehajtani a feladatait- Bioinformatikai módszerek alkalmazásával kapcsolatos munkáját rendszerszemléletű és folyamatorientált gondolkodásmód alapján komplex megközelítésben végzi. Bioinformatikai módszerek alkalmazásával kapcsolatos munkája során vizsgálja a kutatási, fejlesztési és innovációs célok kitűzésének lehetőségét és törekszik azok elérésére, elkötelezett a szakterület új ismeretekkel, tudományos és műszaki eredményekkel való gyarapítására. Bioinformatikai módszerek alkalmazásával kapcsolatos ismeretei és készségei fejlesztésére folyamatosan törekszik. Nyitottan áll a bioinformatikai módszerek alkalmazásával kapcsolatos szakmai törekvéseinek megfelelő továbbképzésekhez. Bioinformatikai módszerek alkalmazásával kapcsolatos tevékenysége során elkötelezett a magas színvonalú, minőségi munkavégzés iránt, és törekszik e szemléletet munkatársai felé is közvetíteni. Bioinformatikai módszerek alkalmazásával kapcsolatos tevékenysége során vezetőként munkatársai véleményének és érveinek megismerése után hozza meg fontosabb döntéseit.

Bioinformatikai módszerek alkalmazásával kapcsolatos szakmai problémák megoldása során önállóan és kezdeményezően lép fel. Bioinformatikai módszerek alkalmazásával felelősséggel viseltetik a fenntarthatóság és környezetvédelem terén. Bioinformatikai módszerek alkalmazásával kapcsolatos döntéseit körültekintően, megfelelő önállósággal, szükség szerint más (nemcsak műszaki) szakterületek képviselőivel konzultálva hozza, azokért felelősséget vállal. Bioinformatikai módszerek alkalmazásával kapcsolatos döntései során figyelemmel van a biztonságra, a környezetvédelem, a minőségügy, a fogyasztóvédelem, a termékfelelősség szempontjaira. Bioinformatikai módszerek alkalmazásával kapcsolatban a munkavédelem, egészségfejlesztés, a műszaki, gazdasági és jogi szabályozás, valamint a mérnöketika alapvető útmutatásait érvényesíti. Bioinformatikai módszerek alkalmazásával kapcsolatban törekszik kollégái, beosztott munkatársai szakmai fejlődésének elősegítésére.