Physical examination of proteins

Az előadások keretében a hallgatók megismerkedhetnek a fehérjék szerkezetét, konformációs stabilitását, és kölcsönhatásait vizsgáló in vitro módszerek elméleti alapjaival (az atomi felbontású módszerek kivételével): fehérjék másodlagos és harmadlagos szerkezetének vizsgálata, cirkuláris dikroizmus-, infravörös- és fluoreszcencia spektroszkópia, fehérjék stabilitásának termodinamikai háttere, fehérjék hődenaturációjának és kémiai denaturálószerrel szembeni stabilitásának vizsgálata spektroszkópiai és kalorimetriai módszerekkel, fehérje-ligandum, fehérje-fehérje kölcsönhatások vizsgálatának elmélete, kölcsönhatási modellek, izotermális titrációs kalorimetria, felszíni plazmon rezonancia, kristály mikromérleg, termoforézis módszere, példafeladatok és számítások.

A gyakorlat keretében megismerkedhetnek néhány alapvető, a fehérjék szerkezetét, stabilitását és kölcsönhatásait vizsgáló módszerrel. Megismerik a műszerek felépítését, beállítási paramétereit, a kísérletek megtervezését. Elsajátítják a mérések kivitelezését, az eredményeket kiértékelik és diszkuttálják. A módszerek a következők:

·         CD - Cirkuláris dikroizmus spektroszkópia (fehérjék másodlagos és harmadlagos szerkezete, fehérjék szerkezeti stabilitása)

·         FTIR – infravörös spektroszkópia (fehérjék másodlagos szerkezete)

·         DSC - Differenciális pásztázó kalorimetria (fehérjék szerkezeti stabilitása)

·         ITC - Izotermális titráló kalorimetria (fehérje-ligandum kölcsönhatás)

·         SPR - Felszíni plazmon rezonancia (fehérje-ligandum kölcsönhatás)

·         MST - Termoforézis (Microscale thermophoresis - fehérje-ligandum kölcsönhatás)

·         QCR - Kristály mikromérleg (fehérje-ligandum kölcsönhatás).