Subject » BMEVIMIAV06
Bioinformatics Laboratory
Bioinformatika laboratórium
A tantárgyleírás hatályossága
Hatályosság kezdete:
—
Hatályosság vége:
—
| Subject name (Hungarian, English) |
Bioinformatika laboratórium
Bioinformatics Laboratory
|
||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Subject code | BMEVIMIAV06 | ||||||||||||
| Subject type | — | ||||||||||||
| Training Level | — | ||||||||||||
| Course types and hours (weekly/semester) |
|
||||||||||||
| Assessment type | félévközi érdemjegy | ||||||||||||
| Credits | 2 | ||||||||||||
| Subject coordinator |
DR. Antal Péter
position: egyetemi docens
contact:
antal.peter@vik.bme.hu
|
||||||||||||
| Responsible department |
—
|
||||||||||||
| Faculty | |||||||||||||
| Subject website | — | ||||||||||||
| Primary curriculum type | — | ||||||||||||
| Direct prerequisites – Strong prerequisite | none | ||||||||||||
| Direct prerequisites – Weak prerequisite | none | ||||||||||||
| Direct prerequisites – Parallel prerequisite | none | ||||||||||||
| Direct prerequisites – Milestone prerequisite | none | ||||||||||||
| Direct prerequisites – Exclusion | none |
Objectives
Programme
A laborfoglalkozásokon a következő témákhoz tartozó szoftvereszközök használata lesz bemutatva:
- Szekvenciaillesztés
- Motívumkeresés
- Filogenetika faépítés
- Újgenerációs szekvenálási adatok: genomösszeállítás
- Újgenerációs szekvenálási adatok: genetikai variánsok detekciója
- Génprioritizálás
- SNP prioritizálás, kísérlettervezés
- Genomikai adatok előkészítése, normalizációja
- Genetikai asszociációs elemzések
- Génexpressziós adatok elemzése
- Omikai adatok útvonal elemzése
- Oksági elemzés
- Diagnosztikai és döntéstámogató modellek építése
- Bioinformatikai nyelvek és munkafolyamatrendszerek
A bioinformatika területeinek, például a szekvenciaelemzéseknek, strukturális modellezésnek, rendszerbiológiának, klinikai genomikának, farmakogenomikának közös jellemzője a szoftvereszközök, web-szolgáltatások, illetve adat- és tudásbázisok sokasága. Az elméleti alapok, algoritmikus problémák megismerése mellett egyre nagyobb hangsúlyt kap az ipari alkalmazás és integráció. A tárgy alapvető eszközök használatát ismerteti, és arra ad lehetőséget, hogy a hallgatók már létező megoldásokról személyes tapasztalatot szerezzenek. A tárgy célkitűzése szerint ez mind akár a korábban megszerzett tudásnak az elmélyítését elősegítheti, vagy éppen a gyakorlattól kiindulva további elméleti ismeretek megszerzésére is sarkallhat.
Learning outcomes
Ez a tantárgy a KKK rendeletben meghatározott, következő kompetenciák fejlesztését szolgálja:
Knowledge
No learning outcomes recorded.
Skills
No learning outcomes recorded.
Attitudes
No learning outcomes recorded.
Autonomy and responsibility
No learning outcomes recorded.
Oktatási módszertan
számítógépes laboratórium
Tanulástámogató anyagok
Not provided.
Recommended preliminary knowledge for completing the subject
Knowledge type competencies
(azon előzetes ismeretek összessége, amelyek megléte nem kötelező, de a tantárgy eredményes teljesítését nagyban elősegíti)
Ajánlott: Valószínűségszámítás, Algoritmusok elmélete, Adatbázisok, Mesterséges intelligencia
Skill type competencies
(azon előzetes képességek és készségek összessége, amelyek megléte nem kötelező, de a tantárgy eredményes teljesítését nagyban elősegíti)
nincs
Recommended (non-compulsory) preliminary competencies
(azon ajánlott (nem kötelező) előzetesen megszerzendő kompetenciák összessége, amelyek jelentősen hozzájárulnak a tantárgy eredményes teljesítéséhez)
Ajánlott: Valószínűségszámítás, Algoritmusok elmélete, Adatbázisok, Mesterséges intelligencia
General rules
Követelmények:
a. A szorgalmi időszakban: laborgyakorlatonkénti számonkéréssel és teljesítéssel, amelyre a hallgatók jegyet kapnak. A jegyek átlaga határozza meg az évvégi osztályzatot.
b. A vizsgaidőszakban: -
c. Elővizsga: -
Az évvégi osztályzatot a félév során kapott jegyek átlaga határozza meg.
Pótlási lehetőségek:
Három alkalom pótlása lehetséges.
Assessment methods
In-term assessments
No detailed assessments provided.
Weight of in-term assessments
No weights provided.
Exam-period assessments
No detailed assessments provided.
Weight of exam elements
No weights provided.
Grade calculation
No grade thresholds provided.
Attendance requirements
No attendance requirements provided.
Rules for retake and resubmission
Not provided.
Short description
Not provided.
Detailed description
Not provided.
Recommended courses
-
Workload to complete the subject
No workload breakdown provided.
Validity of subject requirements
Requirements valid from:
—
Requirements valid until:
—
Curriculum placement
No curriculum placements recorded for this subject version.